Skopjes historia börjar med Thraciens bosättningar och etablering av fästningen Scupi. Staden var en del av den romerska, byzanatinska, bulgariska och med kort varsel av de serbiska länderna. Ottomanerna kommer att erövra staden 1392. De kommer att byta namn till Uskub och platsen kommer att omvandlas till unik i sin typiska stad, som kommer att kallas hem från många ottomaner, bulgarier och albaner. 1912 kommer staden att befrias från ottomaner under första Balkan-kriget och så småningom bli en del av det serbiska landet. Under de två världskrigarna kommer slutligen att ges till det bulgariska landet, innan det i slutändan blev en del och en huvudstad i den makedonska federationen i den jugoslaviska socialistiska republiken. Staden kommer att börja växa snabbt på ekonomiskt och industriellt sätt. Tyvärr har en stor jordbävning 1963 förstört en stor del av staden och lämnat över 100 000 människor utan hem.