Japan Airlines (JL) är landets största flygbolag och har sitt högkvarter i Tokyo. Man flyger nonstop till cirka 60 inrikes destinationer och mer än 30 internationella destinationer i Asien, Europa, Oceanien, Nordamerika och Sydamerika. JL ingår i alliansen Oneworld och har även codeshare-avtal med ungefär 30 andra flygbolag. Bolaget har fyra klasser av service: First Class, Executive Class (motsvarar affärsklass), Premium Economy Class, Class J (ekonomiklass med större stolar) och Economy Class. Flygplansflottan erbjuder en blandning av konfigurationer med två, tre eller fyra sorters kabiner. Japan Airlines primära nav finns på Tokyo's Haneda Airport (HND) och Narita International Airport (NRT).